《阿凡達2》的劇情承接自第一部的十余年后。曾經的地球殘疾軍人杰克·薩利，如今已經是潘多拉星球納美族一方部族的族長，并且與愛妻娜塔莉共同育有一對可愛的兒女，日子過得平淡而充實。然而某天，有個部族的兄弟在海岸附近巡邏時遭到利器割喉身亡。通過現場勘查，以及作為前海軍陸戰隊員的敏銳直覺，杰克判斷已經有人類的阿凡達混入了部落……